The Blood Ontology: An ontology in the domain of hematology

Despite the importance of human blood to clinical practice and research, hematology and blood transfusion data remain scattered throughout a range of disparate sources. This lack of systematization concerning the use and definition of terms poses problems for physicians and biomedical professionals. We are introducing here the Blood Ontology, an ongoing initiative designed to serve as a controlled vocabulary for use in organizing information about blood. The paper describes the scope of the Blood Ontology, its stage of development and some of its anticipated uses

Compositionality and overlapping in biomedical terminology: alternatives for health interoperability

Uma importante fonte de informação para a prática clínica é o prontuário de paciente, um documento que já existe no formato eletrônico. A ambiguidade inerente ao discurso médico tem dificultado a integração automática desejável entre prontuários eletrônicos de pacientes uma vez que, no atual estágio de desenvolvimento tecnológico, os sistemas automáticos não estão aptos a lidar com variações sintáticas e semânticas da linguagem humana. Mesmo as terminologias padronizadas, criadas para lidar com tais variações, não resolvem o problema à medida da multiplicidade de opções. Essas, além dos objetivos e propósitos diversos, têm resultado em redundância, retrabalho e sobreposição entre termos. O presente artigo parte da premissa de que o problema da interoperabilidade é complexo e precisa ser atacado em diversas frentes. Uma dessas frentes, no âmbito dos prontuários eletrônicos de pacientes, envolve situações de caráter conceitual, a saber, a sobreposição epistemológica e a composicionalidade de termos. Vale-se aqui de um modelo baseado em ontologias criado em pesquisa anterior para projetar e testar um método que objetiva atenuar os efeitos dessas situações. O teste é realizado em fragmento da Classificação Internacional de Doenças e conclui-se que as situações de natureza conceitual mencionadas são aspectos relevantes a combater na busca por interoperabilidade.A paramount information source within clinical practice is the patient record , an information-filled document that already exists in electronic format. The inherint inherent ambiguity of theThe ambiguity inherent in medical discourse has hampered the much sought-after automatic integration between electronic health records since, at this stage, automated systems are unable to address the syntactic and semantic complexity of the human language. Even standard terminologies designed to address such complexity are unable to solve the issues involved because of the multiplicity of alternatives, in addition to the fact that they are created for different purposes and goals. All this has resulted in redundancy, rework, and overlapping between terms. This paper assumes that the issue of interoperability is complex and needs to be tackled on several fronts. One of these fronts, in the context of electronic healthcare records, involves two conceptual conditions: epistemological overlapping and term compositionality. After explaining those conditions, we make use of an ontology-based model created on previous research to design and to test a method that aims to compensate for the shortcomings of such conditions. The test was performed on a fragment of the International Classification of Diseases. We found that the aforementioned conceptual conditions are relevant aspects to be faced in seeking interoperability

Um modelo baseado em ontologias para representação da memória organizacional

Exportado OPUSMade available in DSpace on 2019-08-13T06:21:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 doutorado___mauricio_barcellos_almeida.pdf: 5533790 bytes, checksum: abb2a7df3c4da503ae4b8139dbe57830 (MD5) Previous issue date: 10As organizações atuais estão inseridas em um ambiente turbulento, caracterizado pela alta competitividade, pela integração dos mercados e pela redução do ciclo de vida de produtos. Nesse ambiente, a informação e o conhecimento se tornaram essenciais para ao desempenho das empresas. Têm surgido, assim, discussões sobre a forma como as organizações podem preservar o conhecimento que detém para utilização futura, através de estruturas de retenção do conhecimento que buscam reproduzir as características da memória humana. O presente trabalho se insere nesse contexto e tem como objeto o estudo dos problemas advindos da prática de reter conhecimento no ambiente corporativo, e de manipular os mecanismos subjacentes à memória das organizações. A noção de memória tem sido utilizada por diversos autores, que citam o termo memória organizacional utilizando-o como uma metáfora para explicar fenômenosverificados no ciclo de vida das organizações. A presente pesquisa busca enriquecer a discussão sobre a memória das organizações. Para tal, desenvolve-se um modelo baseado em processos humanos e em processos tecnológicos para representar a memória organizacional e, em seguida, verifica-se em campo se tal modelo é válido. Do ponto de vista dos processos humanos, o modelo considera a necessidade de uma linguagem organizacional uniforme, a partir da qual o conhecimento individual se torna conhecimento organizacional, o qual pode ser preservado no ambiente corporativo. Do ponto de vista dos processos tecnológicos, o modelo considera a concepção do componente de representação do conhecimento de uma arquitetura denominada SMO - Sistema de Memória Organizacional. Tal componente corresponde a uma ontologia, estrutura que, além de representar a memória da organização, possibilita a criação e a manutenção de uma linguagem organizacional uniforme. Concebe-se uma ontologia representativa da memória organizacional, alimentada no ambiente de trabalho de uma organização real (CEMIG), no qual o conhecimento apreendido é formalizado e armazenado. Além disso, desenvolve-se um protótipo de um aplicativo que proporciona a apresentação do conhecimento preservado na memória da organização. A validação do modelo é realizada sobre a ontologia, a partir do protótipo.Nowadays, organizations find themselves in an environment of turbulences, featuring high levels of competitiveness, market integration and a reduction in product life cycles. In such an environment, information and knowledge have become essential for the companies performance. Therefore, discussions have begun on how companies may preserve, for future utilization, the knowledge they hold by adopting knowledge retention structures that try to reproduce human memory characteristics. Inserted in this context, this works main subject is the studying of projects evolving from the practice of retaining knowledge in a corporate environment and of handling mechanisms that are subjacent to the memory of organizations. The notion of memory has been utilized by several authors, who mention the term organizational memory and use it as metaphor to explain certain phenomena perceived within the life cycles of organizations. This research seeks to enrich the discussion onthe memory of organizations. To this end, a model based on human processes and on technological processes has been developed. It is intended to represent organizational memory and, following that, perform an on-site verification as to whether such a model is valid or not. From the point of view of human processes, the model considers the necessity of a uniform organizational language, through which individual knowledge becomes organizational knowledge which may be preserved within the organizational environment. From the point of view of technological processes, the model considers the conception of the knowledge representation component of an architecture calledOMS Organizational Memory System. This component corresponds to an ontology, a structure that is likely to represent the history of an organization and also allows for the creation and maintenance of a uniform organizational language. A representative ontology of the organizational memory, nurtured by the working environment of a realorganization (CEMIG) in which the learned knowledge is formalized and stored, has been conceived. Besides that, an application prototype that enables the displaying of the knowledge preserved in the organizational memory has been developed. The validation of this model is made based on the ontology, as a function of the prototype

Inter-operabilidade entre fontes heterogênias: um meta-modelo baseado em ontologias

Exportado OPUSMade available in DSpace on 2019-08-12T02:30:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mestrado___mauricio_barcellos_almeida.pdf: 2206275 bytes, checksum: 053f89233e348f6d9160b9cb610f61c6 (MD5) Previous issue date: 21A explosão da disseminação da informação iniciada a partir do grandeavanço das técnicas computacionais na década de noventa tem trazido muitos benefícios mas restam muitos problemas. Atualmente, o sucesso das instituições, e mesmo das nações, está intimamente relacionado ao uso que fazem das informações que podem manipular. Para execução das tarefas necessárias às empresas, instituições e outros setores da sociedade, as pessoas recebem uma sobrecarga de informações além de sua capacidade e, muitas vezes, não conseguem acessar as que seriam relevantes para a solução de seus problemas. A motivação deste trabalho é a dificuldade em acessar fontes de dados em função de sua heterogeneidade onde se estuda as principaiscaracterísticas de fontes de dados heterogêneos, as questões de representação da informação que permeiam os problemas de integração de fontes de dados e a necessidade de inter-operabilidade em ambientes heterogêneos. Apresentam-se as principais iniciativas internacionais para prover interoperabilidade, além de trabalhos relacionados (componentes, classificação, métricas, dentre outros, em projetos de inter-operabilidade). Propõe-se a integração de fontes heterogêneas de referências bibliográficas através da construção de um meta-modelo que procura prover inter-operabilidade enfatizando aspectos semânticos e utilizando ontologias. Espera-se integrar ometa-modelo resultante ao escopo do sistema de agentes para bibliotecas On-Line (SABiO), projeto de construção de uma biblioteca digital de ciência da informação, em andamento na Escola de Ciência da Informação da UFMG